Le CES offre un service de détection de variations génétiques (Single Nucleotide Polymorphisms ou SNP) et un service de séquençage de novo complet d’un plasmide par extension d’amorces.
Le service de détection/validation de SNP par séquençage de nouvelle génération inclut :
- Design et commande des amorces pour les régions cibles
- Amplification des régions cibles avec la technologie Fluidigm Access Array™ (si applicable)
- Séquençage des amplicons à l’aide de diverses technologies de nouvelle génération (Illumina NovaSeq, HiSeq, MiSeq ou PacBio)
- Détection des SNP entre les échantillons testés ou par rapport à une séquence de référence
- Préparation et envoi d’un rapport d’analyse de variations, incluant une annotation des variations trouvées
Le service de détection/validation de SNP par séquençage Sanger inclut :
- Design et commande des amorces pour les régions cibles
- Amplification des régions cibles par PCR à partir de l’ADN génomique des échantillons testés
- Séquençage des amplicons
- Détection des SNP entre les échantillons testés ou par rapport à une séquence de référence
- Préparation et envoi d’un rapport d’analyse de variations, incluant une annotation des variations trouvées
Le service de séquençage de novo inclut :
- Séquençage de type Sanger
- Design et commande de toutes les amorces nécessaires au séquençage complet du plasmide