Technologie Illumina Protein Prep
Guide d’utilisation
Les instructions de ce guide doivent être suivies attentivement afin d’obtenir les meilleurs résultats possibles et d’éviter tout délai dans le traitement de la requête.
Tous les échantillons ne se conformant pas aux recommandations pourraient être refusés sans compensation.
Noter que les délais d’exécution peuvent varier selon l’ampleur du projet. Il est recommandé de s’informer des délais de traitement auprès du Bureau de gestion clients.
- Informations générales
- Matériel de départ
- Requis – Volume
- Contenants exigés et identification des échantillons
- Requête de service et soumission des échantillons
- Envoi des échantillons
- Transmission des résultats
Informations générales
Importance des conditions de collecte et de traitement
Les protéines plasmatiques et sériques constituent des matrices complexes dont la composition peut être fortement influencée par les conditions pré-analytiques.
Des variations dans la méthode de collecte et le type de tube de collecte, les délais de traitement, les cycles de congélation/décongélation ou les contenants d’entreposage peuvent altérer les profils protéiques détectés par la technologie Illumina Protein Prep, compromettant ainsi la comparabilité des résultats entre échantillons ou entre projets.
Pour plus d’information sur l’importance des conditions de collecte et de traitement ainsi que leur impact sur les résultats, veuillez consulter la ressource suivante : Input and sample collection for the Illumina Protein Prep (IPP) | Illumina Knowledge
Collecte et préparation des échantillons de sang
Les conditions de prélèvement présentées ci-dessous reflètent les recommandations validées par Illumina pour la technologie Illumina Protein Preparation. Pour toute collecte effectuée avec d’autres types de tubes ou selon des conditions différentes, contacter le Bureau de gestion client.
| Paramètre | Plasma | Sérum |
|---|---|---|
| Type de tube de collecte recommandé | Tube avec EDTA | Tube sans anticoagulant |
| Délai de traitement | Traiter dans les 30 min suivant le prélèvement | Laisser coaguler 60 à 90 min à T.A. avant centrifugation |
| Centrifugation | 2200 × g, 15 min à T.A. | 2200 × g, 15 min à T.A. |
| Couches à récupérer | Plasma Éviter la couche leuco plaquettaire | Sérum |
| Aliquotage | Immédiatement après centrifugation | Dans les 30 min suivant la centrifugation |
| Conservation | À –80 °C | À –80 °C |
| Cycles de congélation/décongélation | Minimiser (Recommandation : maximum 2 cycles) | Minimiser (Recommandation : maximum 2 cycles) |
Matériel de départ
Le matériel de départ est du plasma ou du sérum.
Ne pas mélanger les types d’échantillons (plasma et sérum) dans une même demande de service, car ils nécessitent des protocoles distincts et ne peuvent être traitées simultanément.
La présence d’hémolyse dans un échantillon peut affecter les profils protéiques.
Il est recommandé que les échantillons d’un même projet aient subi un nombre similaire de cycles de gel/dégel et aient subit un traitement pré-analytique similaire. En cas de doute, contacter le Bureau de gestion client.
Requis – Volume
| Requis | Minimum | Recommandé |
|---|---|---|
| Volume | ≥55 µL par échantillon | 100 µL |
- Le volume inscrit dans le formulaire de soumission d’échantillons doit correspondre exactement au volume physique.
- Les échantillons de remplacement doivent avoir la quantité totale requise
Contenants exigés et identification des échantillons
Recommandation : utiliser des contenants plastiques à faible adsorption protéique (ex : microtubes ou cryovials certifiés low-binding) afin de minimiser l’adsorption non spécifique et de maximiser la récupération des protéines.
Important : si vos échantillons sont conservés dans un autre type de contenant, veuillez contacter le Bureau de gestion client avant toute décongélation ou transfert d’échantillon afin de valider la compatibilité.
| Contenants recommandés | Contenants acceptés |
| Plaques 2D Matrix – Cat# 3744-WP1D-BR | – Tubes 1.5mL – Cryovials 2mL – Plaque PCR à 96 puits |
- Les échantillons doivent être placés dans la plaque comme indiqué dans le formulaire de soumission.
- Chaque plaque doit contenir uniquement les échantillons appartenant à une seule soumission d’échantillons.
- Chaque contenant doit être identifié exactement comme dans le formulaire de soumission.
Requête de service et soumission des échantillons
Cliquez sur requête de service et soumettre des échantillons pour consulter les instructions.
Envoi des échantillons
Cliquez sur préparation des échantillons pour envoi pour consulter les instructions.
Transmission des résultats
Le rapport Dragen Protein Quantification ainsi qu’un fichier de comptes normalisés en format ADAT seront transmis via Nanuq. D’autres analyses de type expression différentielle ou comparaison multiomique sont disponibles sur demande.
Version 1.0_2026-04-21