Selon le nombre de marqueurs à tester en parallèle et les applications désirées, diverses technologies pour le génotypage de marqueurs bialléliques tels les SNP (polymorphismes à simple nucléotide; Single Nucleotide Polymorphisms) et les indels (polymorphismes d’insertion/délétion) sont disponibles.
Technologies de génotypage
- Analyse entre 1 et plus de 5 millions de loci (SNP, indel ou CNV)
- Génotypage personnalisé pour étudier des régions d’intérêt précises chez n’importe quelle espèce
- Panels commerciaux au contenu standard
Applications
- Études de gènes candidats
- Validation de découverte de SNP (SNP discovery validation)
- Cartographie fine (fine mapping) de régions d’association candidates
- Analyse de liaison (linkage analysis) pour cartographier la position de loci causant un phénotype d’intérêt
- Cartographie de mélange (admixture mapping)
- Études d’association à l’échelle du génome entier (GWAS : Genome-Wide Association Studies) en vue de cartographier la variation génétique parmi des populations afin d’identifier des variantes associées à un phénotype
- Analyses de variation du nombre de copies (CNV : Copy Number Variation)
- Études de cytogénétique
- Cartographie d’homozygotie