Le CES offre le service d’analyse du transcriptome en effectuant des librairies d’ADNc à partir de l’ARN total. Par la suite, elles peuvent être séquencées avec les instruments HiSeq4000 et NovaSeq6000 d’Illumina. Pour en savoir plus au sujet de ce service, consultez les services de séquençage nouvelle génération.
Les services de préparation de librairies incluent différents types de librairies :
- Transcrits codants chez les eucaryotes (ARNm)
- Transcrits codants et longs transcrits non codants (> 200 nt) chez les procaryotes (déplétion des ARN ribosomaux)
- Transcrits codants et longs transcrits non codants (> 200 nt) chez les eucaryotes (déplétion des ARN ribosomaux)
- Transcrits codants et longs transcrits non codants (> 200 nt) chez les eucaryotes et les procaryotes pour des études en métagénomique (déplétion des ARN ribosomaux)
- Tous les transcrits (ARN total)
- Petits ARN (<200 nt)
- miRNA (librairie enrichie en transcrits 22-50 nt)
- Transcrits codants humains d’intérêt (sélections de gènes requis; minimum de 48 échantillons)
- Transcrits codants d’échantillons humains FFPE (minimum de 48 échantillons)
Toutes les librairies sont « strand specific ».