Technologie de génotypage TaqMan® (ThermoFisher scientific)
- Génotypage à petite échelle entre 1 et 4 loci (SNP et indel) en général
- Génotypage personnalisé pour étudier des régions d’intérêt précises chez n’importe quelle espèce
- Essais commerciaux prévalidés (humain et souris)
Applications
- Études de gènes candidats
- Validation de découverte de SNP (SNP discovery validation)
- Cartographie fine (fine mapping) de régions d’association candidates
Description
La chimie TaqMan® est hautement flexible puisqu’elle permet de génotyper divers types de polymorphismes chez n’importe quel organisme. Cette technologie est indiquée pour les projets de génotypage à petite échelle (en général pour de 1 à 4 loci) pour des marqueurs tels les SNP et les indel (polymorphismes d’insertion/délétion) d’au plus 6 bases. Ces essais sont idéaux pour les applications de génotypage incluant les études de criblage, d’association, de région candidate ou encore de cartographie fine.
La chimie TaqMan utilise des sondes fluorogènes (fluorogenic) pour permettre la détection d’un produit PCR spécifique alors qu’il s’accumule durant les cycles PCR. Des sondes fluorogènes différentiellement marquées permettent la discrimination allélique. La détection est réalisée grâce à un instrument de PCR en temps réel. Le taux de conversion moyen des essais du système TaqMan® Génotypage est d’environ 98 % avec un taux d’erreur d’au plus 0,1 %.
Produits disponibles
Le service offert est principalement appuyé sur la collection de 4,5 millions d’essais spécifiques prévalidés (Pre-Designed TaqMan® Assays) offerts par Applied Biosystems (humain et souris). Il est également possible d’élaborer des essais personnalisés.
- TaqMan® Pre-Designed SNP Genotyping Assays
- TaqMan® SNP Genotyping Assay Sets
- TaqMan® Custom SNP Genotyping Assays
NOTE
Un service d’analyse en quantification CNV (TaqMan® CNV ) est également offert.